Diplômé de l'IDHEC, Jean-Pierre Améris réalise en 1987 trois courts métrages, parmi lesquels Intérim, qui lui vaudra l'année suivante le Grand Prix du Festival de Clermont-Ferrand. En 1992, il met en scène son premier long, Le Bateau de mariage, l'histoire d'un instituteur sous l'Occupation. Le film obtient le Prix de la jeunesse au Festival de Tübingen.

Jean-Pierre Améris réalise ensuite Les Aveux de l'innocent, primé plusieurs fois au Festival de Cannes en 1996 : Prix de la Semaine de la critique, Prix de la Jeunesse et Grand Rail d'or. Cinq ans plus tard, il obtient la coquille d'argent au Festival de San Sebastián et l'étoile d'or au Festival international du film de Marrakech avec C'est la vie.

En 2007, Maman est folle obtient quatre prix, dont le Grand Prix et le prix du meilleur scénario, au Festival de la fiction TV de La Rochelle, et, en 2009, le Prix du Meilleur Film TV décerné par le Syndicat de la Critique Cinématographique Française. En 2012, le film Les Émotifs anonymes est récompensé d'un Magritte du meilleur film en coproduction. L’Homme qui rit  a été sélectionné en "Film de clôture de la Mostra de Venise 2012" et Marie Heurtin pour la "Sélection Officielle Locarno 2014" et s’est vu décerné le "Prix du Public Tubingen 2014"